Il Lago Trasimeno è oggetto di ricerche naturalistiche ed ecologiche da circa un secolo. Studi sistematici sono stati condotti soprattutto in seguito alla nascita dell’Istituto di Idrobiologia e Pescicoltura G.B. Grassi di Monte del Lago, nel 1951. Tematiche di ricerca LTER: Cambiamenti climatici, Idrologia, Idrochimica, Fitoplancton, Zooplancton, Macroinvertebrati, Osteitti, Anfibi, Genetica di popolazione, Paleolimnologia.